Kerusakan fisik pada harddisk biasanya dideteksi dengan adanya Bad Sector, dan sering ditandai dengan System freeze yang frekuensinya sering. Salah satu aplikasi yang dapat digunakan untuk tujuan diagnosis harddisk adalah Windows Surface Scanner.
Setelah mengetahui bad sector, selanjutnya dapat diambil tindakan perbaikan menggunakan utilitas Windows Check Disk.